Итак, самое важное в теории то, что она предполагает возможность каких-то осознанных выводов, которые в принципе можно проверить и в результате подтвердить теорию или опровергнуть её. Если многочисленные наблюдения и опыты теорию не подтверждают, значит, её следует исправить, или видоизменить, или вовсе отказаться от старой теории и заменить её новой — которая тоже должна проверяться экспериментом. Но идеи о том, что учёные не должны безоговорочно доверять авторитетам, что необходимо проверять экспериментом научные теории, появились только в конце XIII века в работах английского философа и естествоиспытателя Роджера Бэкона (1214-1292) и были подробно разработаны в трудах Фрэнсиса Бэкона (1561 -1626). Примерно с XVII века начинается и закат алхимии как своеобразной смеси науки, философии и искусства.
Примечательно, что одновременно наука начинает возвращаться к атомистической теории Демокрита.
Об атомах рассуждал французский философ и физик Пьер Гассенди (1592-1655).
Словацкий философ и физик Исаак Цабан (1637-1707) под влиянием работ Гассенди написал трактат «Существование атомов», который был напечатан в 1667 году в Виттенберге в Германии.